Sezon 3, Odcinek 1 A Tale of Two Cities
Data premiery – 4 Październik 2006
Michael podstępem nakłania Hugo, Jack, Kate, i Sawyer’a do wyprawy po Walt’a. Wkrótce wychodzi na jaw, że „Inni” zawarli z rozbitkiem układ. Michael, zgodnie z obietnicą, dostaje łódkę i wraz z Walt’em opuszczają wyspę. Hugo zostaje uwolniony, by przestrzec resztę obozu. Jack, Kate i Sawyer stają się zakładnikami “Innych”.
Sezon 3, Odcinek 2 The Glass Ballerina
Data premiery – 11 Październik 2006
Jack zostaje uwięziony w mrocznym pomieszczeniu. Tymczasem Sayid wraz z Jin i Sun chcą uwolnić porwane osoby. Przygotowują zasadzkę, ale plany ulegają zmianie. Cała trójka zostaje bez żaglówki. Ginie też jedna z „Tamtych”. Kate z Sawyer’em trafiają natomiast do klatek.
Sezon 3, Odcinek 3 Further Instructions
Data premiery – 18 Październik 2006
Locke odzyskuje przytomność, ale nie może wydobyć z siebie głosu. Postanawia zbudować namiot i wprowadzić się w stan transu. Znów ma wizje, więc wraz z Charlie’m rusza na ratunek Mr. Eco. Po powrocie do obozu, John wygłasza przemówienie. Chce ocalić Kate, Sawyer’a i Jacka. Harley doznaje deja vu.
Sezon 3, Odcinek 4 Every Man for Himself
Data premiery – 25 Październik 2006
“Inni” dokonują sadystycznej medycznej procedry, która ma zapobiec stwarzaniu problemów przez Sawyera. W konsekwencji okazuje się ona jedynie testem psychologicznym. Ben zabiera Sawyer’a na spacer i pokazuje mu drugą wysepkę. W tym czasie Jack odkrywa tajemnicę choroby Bena.
Sezon 3, Odcinek 5 The Cost of Living
Data premiery – 1 Listopad 2006
Mr. Eko wspomina przeszłość. Locke zabiera Said’a i kilka innych osób i rusza w poszukiwaniu Mr. Eko. Trafiają na jego ślad i są świadkami niezwykłego zjawiska. Ruszają w stronę wraku samolotu i kryjącego się pod nim bunkra. Eco ginie w dziwnych okolicznościach.
Sezon 3, Odcinek 6 I Do
Data premiery – 8 Listopad 2006
Kate wraca wspomnieniami do czasów narzeczeństwa z Kevinem. Dowiadujemy się więcej faktów z jej życia. Równocześnie „Inni” posługują się Kate i szantażują Jacka. Dziewczyna martwi się o Sawyera. Ostatecznie lekarz godzi się zoperować Bena. Ku zdziwieniu wszystkich Jack sabotuje operację.
Sezon 3, Odcinek 7 Not in Portland
Data premiery – 7 Luty 2007
Julie przypomina sobie życie w Miami. Wiadomo już jak kobieta trafiła na wyspę. Trwa operacja Bena. Jack wydaje przed pozostałymi chytry plan Julie. Usiłuje uwolnić Kate i Sawyer’a, którzy zabierają z sobą Carl’a. Jack dowiaduje się, że również Julie jest szantażowana przez Ben’a.
Sezon 3, Odcinek 8 Flashes Before Your Eyes
Data premiery – 14 Luty 2007
Desmond ratuje ją przed utonięciem. Później instaluje obok namiotu Claire piorunochron, co okazuje się zbawienne. Charlie i Hurley podejrzewają, że Desmond może znać przyszłość. Starają się więc go upić i wyciągnąć z niego jak najwięcej informacji. Charlie odkrywa przerażającą prawdę dotyczącą jego przyszłych losów.
Sezon 3, Odcinek 9 Stranger in a Strange Land
Data premiery – 21 Luty 2007
Sawyer, Kate i Carl docierają w nocy do swojej wyspy. Jack wspomina podróż do Tajlandii. Wychodzi na jaw geneza tatuażu lekarza. Juliete trafia pod sąd „Innych”, grozi jej śmierć. Wybawia ją z opresji Jack.
Sezon 3, Odcinek 10 Tricia Tanaka Is Dead
Data premiery – 28 Luty 2007
Ukazanych zostaje więcej szczegółów z życia Hugo. Dowiadujemy się co robił w Australii i widzimy jak wiele dziwnych przypadków spotykało go w przeszłości. Przeświadczony o złym fatum Harley postanawia sprawdzić czy rzeczywiście czyha na niego śmierć.
Sezon 3, Odcinek 11 Enter 77
Data premiery – 7 Marzec 2007
Sayid, John i Kate starają się uratować Jacka. Odnajdują kolejną stację Dharma i pojawia się nowa postać. Pojawia się Locke i wpływa na dalszy przebieg wydarzeń.
Sezon 3, Odcinek 12 Par Avion
Data premiery – 14 Marzec 2007
Claire wpada na pomysł, jak skontaktować się z resztą świata. Ku jej zaskoczeniu Desmond lekceważy jej osobę. Wkrótce okazuje się jakie były tego powody. Sayid, Locke i Kate starają się przedostać do obozu “Innych”. Biorą na zakładnika Mikhaiła, ale John znów ma inne plany. Rozbitkowie odkrywają cudowną wioskę wroga.
Sezon 3, Odcinek 13 The Man from Tallahassee
Data premiery – 21 Marzec 2007
Kate przedostaje się do Jack’a, jednak ten nie kryje złości z jej powrotu. Wychodzi na jaw, że Jack zawarł z “Innymi” ugodę i że planuje wrócić do domu. Następuje jednak zwrot akcji, gdyż nieprzewidywalny Locke niszczy jedyną szansę na wydostanie się z wyspy.
Sezon 3, Odcinek 14 Exposé
Data premiery – 28 Marzec 2007
Retrospekcje Nikki i Paulo, którzy również byli na pokładzie lotu Oceanic 815. Okazuje się, że są przestępcami, którym jedynie zależy na dostatku. Kończy się to dla nich tragicznie, gdyż wyspa sama znalazła sposób, żeby ich ukarać.
Sezon 3, Odcinek 15 Left Behind
Data premiery – 4 Kwiecień 2007
Akcja rozgrywa się w obozie „Innych”. Okazuje się, że wszyscy opuścili dawne miejsce, pozostawiając jedynie Jacka, Kate i Juliete. Wszystko wskazuje na to, że Lock poszedł z „Innymi”. Hugo podstępem usiłuje nakłonić Sawyer’a do bycia dobrym.
Sezon 3, Odcinek 16 One of Us
Data premiery – 11 Kwiecień 2007
Jack i Kate wracają do obozu. Pojawia się również Juliete, której lekarz ufa. Jack stara się przekonać rozbitków, że mają zaufać kobiecie. Wkrótce Juliete ma okazję uśpić czujność pozostałych osób.
Sezon 3, Odcinek 17 Catch-22
Data premiery – 18 Kwiecień 2007
Juliete zabiera Sun do stacji badawczej. Sprawdzają płód Koreanki i okazuje się, że do zapłodnienia doszło na wyspie. Wszystko wskazuje na to, że Sun niedługo umrze. Desmond przypomina sobie swoją przeszłość w klasztorze. Na wyspie pojawia się nowa postać.
Sezon 3, Odcinek 18 D.O.C.
Data premiery – 25 Kwiecień 2007
Rozbitkowie dowiadują się od spadochroniarki, że pasażerowie lotu Oceanic 815 zginęli. Wszyscy. Znów pojawia się Mikhaił – pomaga uratować Naomi i usiłuje ukraść telefon satelitarny. Rozbitkowie przenoszą ranną do obozu.
Sezon 3, Odcinek 19 The Brig
Data premiery – 2 Maj 2007
John wraca po Sawyer’a. Retrospekcja Locke’a i obraz kolejnej osady „Innych”. Niewiarygodny zwrot akcji. Zabicie oprawcy John’a i zdemaskowanie spisku Bena. Pojawia się również postać Rousseau.
Sezon 3, Odcinek 20 The Man Behind the Curtain
Data premiery – 9 Maj 2007
Ben zabiera Locke’a na spotkanie z Jacob’em. Benniamin wspomina przeszłość. Locke pragnie odkryć tajemnicę wyspy, jednak spotkanie z Jacob’em kończy się fiaskiem. Ben zdradza Locke’a. Rozbitkowie dowiadują się o planie porwania przez „Innych”.
Sezon 3, Odcinek 21 Greatest Hits
Data premiery – 16 Maj 2007
Desmond doświadcza kolejnej wizji śmierci Charliego. Tym razem nie chce go chronić, bo wie, że śmierć jest imperatywem przetrwania rozbitków. Mówi o wszystkim Charlie’mu. W międzyczasie rozbitkowie odkrywają, że atak “Innych” jest bliższy niż się wszystkim wydawało.
Sezon 3, Odcinek 22 Through the Looking Glass
Data premiery – 23 Maj 2007
Jack wraz z rozbitkami zmierzają w stronę nadajnika. Ben szantażuje lekarza. Charlie wraz z Desmond’em ruszają w stronę podwodnej stacji badawczej, by ją zatopić. Charlie trafia do niewoli. Sayid, Jin i Bernard przygotowują zasadzkę na “Innych”, ale nie udaje się i zostają pojmani.. Na ratunek rusza Sawyer z Juliete,. Ku ich zaskoczeniu Harley wkracza do akcji. W końcu udaje się nawiązać kontakt z łodzią.